(1) ผู้อำนวยการเฉพาะด้าน (วิชาการส่งเสริมการเกษตร)
(2) ฝ่ายบริหารทั่วไป
(3) กลุ่มพัฒนาบุคลากร (ได้แก่ กลุ่มพัฒนาบุคลากร และกลุ่มส่งเสริมและพัฒนาเกษตรกร ตามโครงสร้างที่ใช้ในปัจจุบัน)
(4) กลุ่มวิชาการส่งเสริมการเกษตร (ได้แก่ กลุ่มส่งเสริมและพัฒนาการผลิต ตามโครงสร้างที่ใช้ในปัจจุบัน)
(5) กลุ่มยุทธศาสตร์และสารสนเทศ

          ทั้งนี้ มีศูนย์ปฏิบัติการต่าง ๆ ในสังกัดสำนักงานส่งเสริมและพัฒนาการเกษตรที่ 4 จังหวัดขอนแก่น จำนวน 12 ศูนย์ (ปัจจุบันมี 8 ศูนย์) คือ
(1) ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาอาชีพการเกษตร จังหวัดขอนแก่น
(-) ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาอาชีพการเกษตร จังหวัดนครราชสีมา (ไม่มีตามโครงสร้างปัจจุบัน ปรับเป็นศูนย์ขยายพันธ์ุพืช)
(-) ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาอาชีพการเกษตร จังหวัดบุรีรัมย์ (ไม่มีตามโครงสร้างปัจจุบัน ปรับเป็นศูนย์ขยายพันธ์ุพืช)
(-) ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาอาชีพการเกษตร จังหวัดมหาสารคาม (ไม่มีตามโครงสร้างปัจจุบัน ปรับเป็นศูนย์ขยายพันธ์ุพืช)
(2) ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาอาชีพการเกษตร จังหวัดยโสธร
(3) ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาอาชีพการเกษตร จังหวัดเลย
(-) ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาอาชีพการเกษตร จังหวัดอุดรธานี (ไม่มีตามโครงสร้างปัจจุบัน ปรับเป็นศูนย์ขยายพันธ์ุพืช)
(4) ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาอาชีพการเกษตร จังหวัดหนองคาย
(5) ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาอาชีพการเกษตร จังหวัดเลย (เกษตรที่สูง)
(6) ศูนย์ส่งเสริมเทคโนโลยีการเกษตรด้านอารักขาพืช จังหวัดขอนแก่น
(7) ศูนย์ส่งเสริมเทคโนโลยีการเกษตรด้านอารักขาพืช จังหวัดนครราชสีมา
(8) ศูนย์ส่งเสริมเทคโนโลยีการเกษตรด้านวิศวกรรม จังหวัดร้อยเอ็ด

          สำนักงานส่งเสริมและพัฒนาการเกษตรที่ 4 จังหวัดขอนแก่น กำกับ ดูแลสำนักงานเกษตรจังหวัดในภาคตะวันออกเฉียงเหนือ จำนวน 20 จังหวัด ได้แก่
(1) สำนักงานเกษตรจังหวัดกาฬสินธุ์
(2) สำนักงานเกษตรจังหวัดขอนแก่น
(3) สำนักงานเกษตรจังหวัดชัยภูมิ
(4) สำนักงานเกษตรจังหวัดนครพนม
(5) สำนักงานเกษตรจังหวัดนครราชสีมา
(6) สำนักงานเกษตรจังหวัดบึงกาฬ
(7) สำนักงานเกษตรจังหวัดศรีสะเกษ
(8) สำนักงานเกษตรจังหวัดบุรีรัมย์
(9) สำนักงานเกษตรจังหวัดมหาสารคาม
(10) สำนักงานเกษตรจังหวัดมุกดาหาร
(11) สำนักงานเกษตรจังหวัดร้อยเอ็ด
(12) สำนักงานเกษตรจังหวัดเลย
(13) สำนักงานเกษตรจังหวัดสกลนคร
(14) สำนักงานเกษตรจังหวัดหนองคาย
(15) สำนักงานเกษตรจังหวัดหนองบัวลำภู
(16) สำนักงานเกษตรจังหวัดอุดรธานี
(17) สำนักงานเกษตรจังหวัดยโสธร
(18) สำนักงานเกษตรจังหวัดสุรินทร์
(19) สำนักงานเกษตรจังหวัดอำนาจเจริญ
(20) สำนักงานเกษตรจังหวัดอุบลราชธานี